A instituição realiza pesquisas antes da existência de uma sede própria, totalizando 60 anos de atividades, por meio de projetos como PRONAPA, PRONAPABA, PROPA entre outros. Esses projetos registraram, aproximadamente, 1000 sítios, formando um acervo de mais de 1 milhão de peças. Como resultado, trouxeram muito conhecimento sobre a diversidade cultural do norte, sul e centro-oeste brasileiro, sistematizado em publicações e trabalhos acadêmicos da área.
Além de sua importância científica, como uma referência em pesquisa nacional, a instituição contribuiu para o desenvolvimento da arqueologia brasileira, sendo colaboradora no PRONAPA (Programa Nacional de Pesquisas Arqueológicas). O programa propiciou a estruturação
da profissão, ampliando, sistematizando e profissionalizando o trabalho arqueológico no território brasileiro.
Atualmente, o Marsul não está disponível para endossos institucionais de pesquisas, com exceção para projetos que envolvam o seu acervo. A instituição, portanto, disponibiliza seu laboratório e instalações para pesquisadores de instituições públicas ou privadas, que tenham seus projetos relacionados ao acervo salvaguardado. Para agendamentos e visitas técnicas entrar em contato pelo e-mail: marsul@sedac.rs.gov.br
